Soutenance de thèse de Madame Elena SPIRINA MENAND10h00 | Institut de Cancérologie de l'Ouest | Amphithéâtre | 15, rue André Boquel | ANGERS

Le 19 décembre 2022

Sujet : La recherche de nouveaux bio-marqueurs pour les séquences thérapeutiques des cancers «pan-gyn» grâce à l’apprentissage automatique.

Directeur de thèse : Monsieur Pierre CHAUVET

Résumé

L’expression des gènes est connue pour être associée à la survie globale chez les patients avec un cancer. L’analyse de survie pour le cancer de l’ovaire permet potentiellement non seulement la stratification des patientes mais également la recherche des nouvelles cibles thérapeutiques. Ce travail présente l’étude des techniques d’analyse de survie récentes basées sur des ré seaux de neurones artificiels (ANN) et compare la performance de ces modèles sur la base des données RNA-seq des tumeurs ovariennes. Il souligne également le fait que ces modèles d’apprentissage profond sont capables de transférer la connaissance à travers le groupe "pan-gyn" dans le but d’améliorer la précision des prédictions au niveau du cancer de l’ovaire car ce groupe des cancers gynécologiques et du sein partage de charactéristiques communes. Cette thèse propose un nouveau modèle de survie basé sur l’apprentissage profond, appelé N-MTLR-Rank, ce dernier a été entrainé avec les données du TCGA (The Cancer Genome project) et validé avec un dataset indépendant. De plus, elle dé montre comment ce modèle peut être apparenté à des voies biologiques en lien avec la survie des patientes avec le cancer de l’ovaire.